Dzisiaj po kompleksie archeologicznym Q'enqo pozostały jedynie wyrzeźbione skały, których nie zdołali zniszczyć Hiszpanie; niewiele zostało ze ścieżek i akweduktów, a także z pomieszczeń, magazynów czy łaźni liturgicznych, nie licząc wielkiej warstwy złota, która niegdyś oświetlała całe to miejsce.
Q´enqo było prawdopodobnie używane przez Inków jako centrum kultu; jego korytarze, przypominające labirynt, mają po bokach liczne kanały w kształcie Amaru (węży), przez które spływała krew składanych w ofierze zwierząt – zazwyczaj najpiękniejszych i najbardziej wyjątkowych; być może to właśnie dlatego wybierano czarne zwierzęta. Niektórzy kronikarze, jak Juan de Betanzos, opisują to jako „dziki akt popełniany przez Inków, którzy składali w ofierze nie tylko zwierzęta, ale także noworodki obdarzone szczególnym pięknem; według Inków te istoty rodziły się piękne, aby dołączyć do bogów”.
Q´enqo posiada komnatę ofiarną w jednej ze swoich podziemnych komnat, gdzie wyróżnia się duża skała, która, według kronikarzy, była pokryta złotem. W górnej części komnaty można zobaczyć otwór, który znajdował się dokładnie nad wspomnianą skałą. Światło księżyca przenikało przez ten otwór, rozświetlając złotą powłokę i oświetlając całe miejsce. Niektórzy historycy twierdzili, że w Q´enqo znajduje się grobowiec Inki Pachacuteca, najważniejszego ze wszystkich.